作為公營學校,仁濟醫院第二中學一直致力建立開明管理文化。本校早在1997年推行「校本管理」,並在校董會陸續加入主要持分者代表,包括:
仁濟二中校董會自2003年已發展為由6大類別持分者組成,並邀請了其他界別的獨立人士擔任本校校董,從而確保最高管理層在決策過程集思廣益,作出具前瞻性的決定。
校董會內的家長代表、校友代表及教師代表均透過選舉產生。
現屆家長校董:劉樹平先生、梁翠珊女士 (家長教師會主席)
現屆校友校董:洪鎮峰先生 (校友會會長)
現屆教師校董:楊子曦老師、邱志琪老師
全校分組檢討會議 (教師、校友、學生、家長)
除了校董會引入各持分者代表外,仁濟醫院第二中學自2003年開始,亦於每年全校分組檢討會議中,邀請校友會、學生會、家長教師會派出代表,擔任會議成員。
「全校分組檢討會議」屬於「仁濟二中 - 自評機制」重要一環,負責檢討學校重要政策及主要經費的運用原則,旨於集思廣益,尊重各持分者在學校發展的角色和貢獻,以及提升校政透明度。